Jego historia sięga 1975 r., gdy z myślą o potrzebach mieszkańców regionu powołany został Wojewódzki Szpital Zespolony, ale dopiero w 1983 r. powołano Wojewódzki Szpital w Budowie.

Kolejne lata to dynamiczny rozwój szpitala i dążenie do podnoszenia jakości świadczonych usług. Od tej pory systematycznie wzrasta liczba oddziałów, powstaje wiele specjalistycznych poradni, pracowni i przychodni. Wszystkie działania mają na celu ułatwienie dostępu do profesjonalnych usług medycznych i zwiększenie komfortu pobytu pacjentów w szpitalu.

W 1998 r. Szpital Wojewódzki w Budowie przekształcono w Samodzielny Specjalistyczny Szpital Wojewódzki a w 2002 r. zmieniono jego nazwę na Wojewódzki Szpital Specjalistyczny w Siedlcach.

Od 1998 r. powstawały kolejne oddziały. W 1999 r. działalność rozpoczęła Szkoła Promocji Zdrowia. Jej głównym zadaniem stało się upowszechnianie wiedzy na temat prozdrowotnego stylu życia wśród młodzieży. Od 2003 r. otwarty został Szpitalny Oddział Ratunkowy.

Rok 2007 przyniósł rozszerzenie oferty szpitala m.in. o usługi z zakresu podstawowej opieki zdrowotnej. Otwarto Przychodnię Medycyny Rodzinnej OMEGA. W tym roku włączono szpital do programu telemedycyny ratunkowej LIFENET. Cały czas trwa inwestowanie w placówkę – przede wszystkim wyposażanie jej w specjalistyczny sprzęt oraz modernizowanie.

Od stycznia 2011 r. dawny Wojewódzki Szpital Specjalistyczny funkcjonuje jako Mazowiecki Szpital Wojewódzki w Siedlcach Sp. z o.o. i prowadzi działalność medyczną w ramach Siedleckiego Szpitala Specjalistycznego i Zespołu Lecznictwa Ambulatoryjnego.

W ramach Szwajcarsko-Polskiego Programu Współpracy w szpitalu zostaną zainstalowane kolektory o łącznej powierzchni czynnej 666 m².